hum0197 リリース情報
| Research ID | 公開日 | 内容 |
|---|---|---|
| hum0197.v22 | 2024/11/11 | NGS（WGS、RNA-seq） |
| hum0197.v21 | 2024/10/28 | 自己免疫疾患のゲノムワイド関連解析、自己免疫疾患のNGS（WGS）より算出した内在性ヘルペスウイルス6（eHHV-6）の有無およびアネロウイルス量、eHHV-6B陽性および陰性SLEのscRNA-seqデータ、縄文割合のゲノムワイド関連解析 |
| hum0197.v20 | 2024/05/30 | 不育症のゲノムワイド関連解析 |
| hum0197.v19 | 2024/05/29 | 2型糖尿病のGWASより算出した各バリアントの重みデータ |
| hum0197.v18 | 2023/10/02 | 腸内微生物叢、血中代謝物、KEGG Gene OrthologおよびKEGG Pathwayのゲノムワイド関連解析 |
| hum0197.v17 | 2023/06/27 | 間質性膀胱炎ハンナ型のゲノムワイド関連解析 |
| hum0197.v16 | 2023/06/06 | 15形質のゲノムワイド関連解析 |
| hum0197.v15 | 2023/03/29 | メタゲノム |
| hum0197.v14 | 2023/02/16 | 5形質のゲノムワイド関連解析 |
| hum0197.v13 | 2023/02/14 | scRNA-seqデータ、臨床情報 |
| hum0197.v12 | 2022/12/01 | 微生物ゲノムのMAG、ウイルスのゲノム配列、CRISPR spacer配列 |
| hum0197.v11 | 2022/07/21 | scRNA-seqデータ |
| hum0197.v10 | 2022/06/16 | 9形質のゲノムワイド関連解析 |
| hum0197.v9 | 2022/06/10 | 頭蓋内胚細胞腫瘍のゲノムワイド関連解析 |
| hum0197.v8 | 2022/06/03 | メタゲノム |
| hum0197.v7 | 2022/05/23 | メタゲノム |
| hum0197.v6 | 2022/02/08 | miRNAリードカウント、eQTL解析データ |
| hum0197.v5 | 2021/12/21 | 10形質のゲノムワイド関連解析、79形質のFine-mapping |
| hum0197.v4 | 2021/12/10 | メタゲノム |
| hum0197.v3 | 2021/03/22 | 215形質のゲノムワイド関連解析 |
| hum0197.v2 | 2020/11/27 | 肺胞蛋白症のゲノムワイド関連解析、メタゲノム |
| hum0197.v1 | 2019/11/15 | メタゲノム |
hum0197.v22
HPV関連中咽頭がん患者14例の腫瘍組織および血液から抽出したDNAを用いたWGS解析データ、ならびに、HPV関連中咽頭がん患者19例、HPV非関連中咽頭がん患者17例の腫瘍組織、および健常対象者2名の正常扁桃から抽出したRNAを用いたRNA-seq解析データを提供する（fastq）。
hum0197.v21
自己免疫疾患2,238症例、対照群2,919名を対象とした全ゲノムシーケンスから算出した内在性ヘルペスウイルス6（eHHV-6）の有無やアネロウイルス量データ（tsv）およびeHHV-6B陽性自己免疫疾患22症例と陰性216症例のゲノムワイド関連解析データ（tsv）およびeHHV-6B陽性SLE3症例と陰性SLE5症例のシングルセルRNAシーケンスデータ（fastq）ならびにバイオバンク・ジャパン171,287名における縄文割合を形質としたゲノムワイド関連解析データ（txt）を提供する。
hum0197.v20
不育症1,728症例および対照者24,315名の末梢血から抽出したDNAを用いたSNPアレイ解析によりgenotypeを決定し、Imputation後、GWASを実施した結果（統計情報）を提供する（txt）。
hum0197.v19
バイオバンク・ジャパン2型糖尿病症例27,642名と対照群70,242名、UKバイオバンクの2型糖尿病症例27,642名と対照群70,242名のゲノムワイド関連解析データを基に算出した、ポリジェニックスコア予測対象である東北メディカル・メガバンクおよびバイオバンク・ジャパン2次コホートに存在する多型の重みデータを提供する（txt）。
hum0197.v18
日本人集団524名の末梢血から抽出したDNAを用いた腸内微生物叢のゲノムワイド関連解析データ、日本人集団362名の末梢血から抽出したDNAを用いた血中代謝物のゲノムワイド関連解析データ、日本人集団524名の末梢血から抽出したDNAを用いたKEGG Gene OrthologおよびKEGG Pathwayのゲノムワイド関連解析データを提供する（txt）。
hum0197.v17
間質性膀胱炎ハンナ型144症例および健常者41,516名の末梢血から抽出したDNAを用いたSNPアレイ解析によりgenotypeを決定し、Imputation後、GWASを実施した結果（統計情報）を提供する（txt）。
hum0197.v16
バイオバンク・ジャパン180,215名およびUKバイオバンク377,441名の末梢血から抽出したDNAを用いた、15形質のゲノムワイド関連解析データ、ならびに、FinnGen、Breast Cancer Association Consortium（BCAC）、Prostate Cancer Association Group to Investigate Cancer Associated Alterations in the Genome（PRACTICAL）の要約統計量を含めたメタ解析（乳がん：648,746名、前立腺がん：482,080名）データを提供する（txt）。
hum0197.v15
下記のメタゲノム関連解析データを提供する（fastq）。
・日本人88名の便より抽出したDNAを用いた、ショットガンシークエンスデータ。
・健常者73名の便より抽出したDNA（フェノール・クロロホルム法＋DNeasy PowerSoil Pro Kit）を用いた、ショットガンシークエンスデータ。
・日本人5名の便より抽出したDNAを用いた、高深度ショットガンシークエンスデータ。
hum0197.v14
日本人集団および多人種集団（バイオバンク・ジャパン：179,000名、UKバイオバンク：361,000名、FinnGen：136,000名）の末梢血から抽出したDNAを用いた、5形質のゲノムワイド関連解析データを提供する（txt）。
hum0197.v13
日本人集団におけるCOVID-19患者43症例と健常者44名の末梢血単核細胞（PBMC）から抽出したRNAを用いたscRNA-seq解析データ（fastq）、およびhum0019.v11とhum0197.v13の臨床情報（xlsx）を提供する。
hum0197.v12
hum0197.v7およびhum0197.v8のメタゲノム関連解析に関連して得られた日本人腸内微生物のMAG・ウイルスのゲノム配列・CRISPR spacer配列を提供する（fasta）。
hum0197.v11
日本人集団におけるCOVID-19患者30症例と健常者31名の末梢血単核細胞（PBMC）から抽出したRNAを用いたscRNA-seq解析データを提供する（fastq）。
hum0197.v10
バイオバンク・ジャパン161,801名およびUKバイオバンク377,583名の末梢血から抽出したDNAを用いた、9形質のゲノムワイド関連解析データを提供する（txt）。
hum0197.v9
頭蓋内胚細胞腫瘍133症例および健常者762名の末梢血から抽出したDNAを用いたSNPアレイ解析によりgenotypeを決定し、Imputation後、GWASを実施した結果（統計情報）を提供する（txt）。
hum0197.v8
日本人集団136名の便より抽出したDNAを用いた、全ゲノムショットガンシークエンスによるメタゲノム関連解析データを提供する（fastq）。
hum0197.v7
潰瘍性大腸炎35症例、クローン病39症例、対照健常者40名の便より抽出したDNAを用いた、全ゲノムショットガンシークエンスによるメタゲノム関連解析データを提供する（fastq）。
hum0197.v6
日本人集団141名の全血および末梢血単核球（PBMC）を分取し、全血から抽出したgenomic DNAを用いた全ゲノムシーケンス、PBMCから抽出したRNAを用いたsmall RNA-seqを実施した。個人毎のmiRNAリードカウントデータおよびeQTLサマリーデータを提供する（txt）。
hum0197.v5
日本人集団（バイオバンク・ジャパン：179,000名）の末梢血から抽出したDNAを用いた、10形質のゲノムワイド関連解析データおよび79形質のFine-mappingデータを提供する（txt）。
hum0197.v4
日本人集団227＋30名の便より抽出したDNAを用いた、全ゲノムショットガンシークエンスによるメタゲノム関連解析データを提供する（fastq）。
hum0197.v3
日本人集団および多人種集団（バイオバンク・ジャパン：179,000名、UKバイオバンク：361,000名、FinnGen：136,000名）の末梢血から抽出したDNAを用いた、215形質のゲノムワイド関連解析データを提供する（txt）。
hum0197.v2
・肺胞蛋白症198症例および対照者395名の末梢血から抽出したDNAを用いてSNPアレイによりgenotypeを決定、Imputation後、GWASを実施した結果（統計情報）を提供する（txt）。
・日本人集団103名の便より抽出したDNAを用いた、全ゲノムショットガンシークエンスによるメタゲノム関連解析データを提供する（fastq）。
hum0197.v1
日本人集団95名の便より抽出したDNAを用いた、全ゲノムショットガンシークエンスによるメタゲノム関連解析データを提供する（fastq）。
Note：
