NBDC Research ID: hum0124.v1
研究内容の概要
目的： ヒト上皮成長因子受容体（epidermal growth factor receptor：EGFR）遺伝子変異をもつ肺がん発癌関連遺伝子同定
方法： エクソーム解析
対象： EGFR遺伝子変異をもつ肺がん症例
| データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| JGAS000129 | NGS（Exome） | 制限公開（Type I） | 2018/04/06 |
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分子データ
| 対象 | EGFR遺伝子変異をもつ肺がん（ICD10：C34）：3症例（1家系） |
| 規模 | Exome |
| 対象領域（Target Captureの場合） | - |
| Platform | Illumina [HiSeq 2000] |
| ライブラリソース | 末梢血から抽出したDNA |
| 検体情報（購入の場合） | - |
| ライブラリ作製方法（キット名） | SureSelect Target Enrichment System Human All Exon V2 |
| 断片化の方法 | 超音波断片化（Covaris） |
| ライブラリ構築方法 | Single-end |
| リード長（除：バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー） | 50 bp |
| Japanese Genotype-phenotype Archive Data set ID | JGAD000140 |
| 総データ量 | 9 GB （bam [ref：hg18]） |
| コメント（利用にあたっての制限事項） | NBDC policy |
提供者情報
研究代表者： 菊地 利明
所 属 機 関： 新潟大学大学院 医歯学総合研究科
プロジェクト/研究グループ名： 呼吸器･感染症内科学分野
URL： http://www.med.niigata-u.ac.jp/resp/welcome.html
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 日本医療研究開発機構（AMED） 次世代がん研究シーズ戦略的育成プログラム（P-DIRECT） | EGFR（上皮成長因子受容体）遺伝子変異陽性肺がんの遺伝子学的発がん機構の解明 | JP15cm0106073 |
| 科学研究費助成事業 挑戦的萌芽研究 | ＥＧＦＲ（上皮成長因子受容体）遺伝子変異陽性肺癌の分子遺伝学的発生母地の解明 | 24659399 |
関連論文
| タイトル | DOI | データID | |
|---|---|---|---|
| 1 | Exome sequencing deciphers a germline MET mutation in familial epidermal growth factor receptor-mutant lung cancer. | doi: 10.1111/cas.13233 | JGAD000140 |
| 2 |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | 利用データID | 利用期間 |
|---|---|---|---|---|---|
| 中岡 博史 | 公益財団法人佐々木研究所 腫瘍ゲノム研究部 | 日本 | 肺がん遺伝子解析研究 | JGAD000140 | 2022/08/06-2023/03/31 |
