hum0112 リリース情報
| Research ID | 公開日 | 内容 |
|---|---|---|
| hum0112.v1 | 2017/12/14 |
NGS（PBAT-seq） NGS（ChIP-seq） NGS（RNA-seq） NGS（miRNA-seq） |
hum0112.v1
NGS（PBAT-seq）
ヒト胎盤幹細胞より抽出したDNAを用いたPBAT-seq解析の結果をfastqファイルにて提供する。Post-Bisulfite Adaptor-Tagging（PBAT）法によりライブラリを作製し、Illumina [HiSeq 1500]によりシングルエンドシークエンシングを行っている（101 bp）。
NGS（ChIP-seq）
ヒト胎盤幹細胞より抽出したDNAを用いたChIP-seq解析の結果をfastqファイルにて提供する。抗H3K4me3, H3K4me1, H3K9me3, H3K27ac, H3K27me3, H3K36me3抗体を用いて免疫沈降後Ovation Ultralow System V2 kit (NuGEN)を用いてChIP-seqライブラリを作製し、Illumina [HiSeq 2500]によりペアエンドシークエンシングを行っている（126 bp）。
NGS（RNA-seq）
ヒト胎盤幹細胞より抽出したmRNAを用いたRNA-seq解析の結果をfastqファイルにて提供する。TruSeq Stranded mRNA LT Sample Prep Kit (Illumina)を用いてライブラリを作製し、Illumina [HiSeq 2500]によりペアエンドシークエンシングを行っている（101 bp）。
NGS（miRNA-seq）
ヒト胎盤幹細胞より抽出したRNAを用いたmiRNA-seq解析の結果をfastqファイルにて提供する。NEBNext Small RNA Library Prep Set for Illumina (New England Biolabs)を用いてライブラリを作製し、Illumina [HiSeq 1500]によりシングルエンドシークエンシングを行っている（64 bp）。
Note：マッピング済のデータが間もなくIHEC Data Portal（http://ihec-epigenomes.org/）より利用可能となります
