hum0032 リリース情報
| Research ID | 公開日 | 内容 |
|---|---|---|
| hum0032.v1 | 2016/07/22 | NGS（PBAT-seq、ChIP-seq、RNA-seq） |
hum0032.v1
NGS（PBAT-seq）
肝部分切除術検体から純化した肝細胞から抽出したDNAを用いWGBS解析した結果をFastqファイルにて提供する。Post-Bisulfite Adaptor-Tagging（PBAT）法（http://crest-ihec.jp/epigenome/index.html）でライブラリ作製し、HiSeq 2000（Illumina）によりシングルエンドシークエンシングを行っている。
NGS（ChIP-seq）
肝部分切除術検体から純化した肝細胞から抽出したDNAを用いChIP-seq解析した結果をFastqファイルにて提供する。抗H3K4me3,H3K9me3, H3K27me3, H3K27ac, H3K4me1, H3K36me3モノクローナル抗体（東京工業大学木村宏教授提供）を用いて免疫沈降後ChIP-Seqライブラリを作製し、HiSeq 2000もしくは2500（Illumina）によりシークエンシング行っている。
NGS（RNA-seq）
肝部分切除術検体から純化した肝細胞から抽出したDNAを用いRNA-seq解析した結果をFastqファイルにて提供するIllumina TruSeq RNA Library Preparation Kit v2 ないし Agilent SureSelect Strand Specific RNA kitによるライブラリ作製、HiSeq 2000（Illumina）での100bpペアエンドシークエンシングを行っている。
Note：
