NBDC Research ID: hum0007.v1
研究内容の概要
目的： Th1細胞およびTh17細胞における遺伝子発現を解析することで、自己免疫疾患の原因解明や治療方法の確立を目指す
方法： AppliedBioSystem SoLiDを使用したRNA-Seq解析
対象： 健常者1名の末梢血から単離したナイーブT細胞、Th1細胞、inactive-Th17、active-Th17
| データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| JGAS000005 | NGS（RNA-seq） | 制限公開（Type I） | 2015/02/12 |
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分子データ
| 対象 | 健常者1名（ナイーブT細胞、Th1細胞、inactive-Th17、active-Th17） |
| 規模 | RNA-seq |
| 対象領域（Target Captureの場合） | - |
| Platform | Applied BioSystem [5500 Genetic Analyzer] |
| ライブラリソース |
ヒト末梢血リンパ球から調整した免疫細胞（ナイーブCD4+ T細胞、Th１細胞、活性化前CD161+Th17 細胞、活性化後CD161+Th17細胞）からRNAを抽出 Th17細胞の活性化については、IL-1βとIL-23を用いたTh17誘導刺激を実施 |
| 検体情報（購入の場合） | - |
| ライブラリ作製方法（キット名） | Applied BioSystem [SoLiD SAGE Kit] |
| 断片化の方法 | - |
| ライブラリ構築方法 | Paired-end |
| リード長（除：バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー） | 35 bp |
| Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID | JGAD000005 |
| 総データ量 | 12.16 GB |
| コメント（利用にあたっての制限事項） | NBDC policy |
提供者情報
研究代表者： 巌本 三壽
所 属 機 関： 昭和大学医学部 生化学教室
プロジェクト/研究グループ名： ヒトTh17細胞サブセットに関する研究
URL： http://www10.showa-u.ac.jp/~biochem/Biochem/Biochem_top.html
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| - | - | - |
関連論文
| タイトル | DOI | データID | |
|---|---|---|---|
| 1 | TNF-alpha drives human CD14+ monocytes to differentiate into CD70+ dendritic cells evoking Th1 and Th17 responses. | doi:10.4049/jimmunol.179.3.1449 | JGAD000005 |
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制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | 利用データID | 利用期間 |
|---|---|---|---|---|---|
| 浜田 道昭 | 早稲田大学 理工学術院 | 日本 | RNA標的創薬データベースの構築 | JGAD000005 | 2022/12/26-2025/03/31 |
