データセット ID
NHA000179
- データの種類
- 微生物ゲノムのMAG・ウイルスのゲノム配列・CRISPR spacer配列
- アクセス制限
- 非制限公開
- 研究
- hum0197
- 公開日
- 2022-12-01
- 更新日
- 2022-12-01
- Secondary ID
- hum0197.v12.VIRUS.v1
解析手法
NGS (WGS)
- 材料と対象者
- 日本人腸内微生物ゲノム
JGAS000205/JGAS000260/JGAS000316/JGAS000415/JGAS000530/JGAS000531、公開データ（DRA006684）より取得 - 対象集団日本人
- 試料説明
- JGAS000205/JGAS000260/JGAS000316/JGAS000415/JGAS000530/JGAS000531、DRA006684より取得した配列
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WGS
- 測定対象
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
Illumina HiSeq 3000
Illumina NovaSeq 6000 - 解析方法
- metaspadesによるde novo assemblyの後に、virfinder及びvirsorterによってウイルスゲノムを検出。
- 加工データの種類
- ウイルスゲノム
- INSDC配列 Accession
- JGAS000205/JGAS000260/JGAS000316/JGAS000415/JGAS000530/JGAS000531：BRDB01000001-BRDB01028816
DRA006684：EMNW01000001-EMNW01002579