本文へ
NBDC ヒトデータベース

カートに入れたデータセットはありません。

カートを見る

システムメンテナンスに伴い、以下の日程で、NBDCヒトデータベース申請システムならびにヒトデータ審査委員会による審査が停止いたします。
停止期間：2026年10月5日(月) 9:00 ～ 10月7日(水) 15:00
ご迷惑をおかけしますが、どうぞ宜しくお願いいたします。

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

NHA000070

データの種類
162,255名の58臨床検査値のGWAS
アクセス制限
非制限公開
総データ量
7.3 GB
ファイル形式
  • MAP
  • HTML
  • ZIP
研究
hum0014
公開日
2018-05-01
更新日
2018-05-01
Secondary ID
hum0014.v8.58qt.v1

このデータセットに紐づく非制限公開ファイル

URL の一覧のダウンロード
表示件数
100
2050100

1–59 / 59 件

ファイル名ラベルサイズURL のコピー
hum0014.v8.AG.zip血清蛋白質: アルブミン/グロブリン比126 MB
hum0014.v8.ALP.zip肝機能: アルカリフォスファターゼ127 MB
hum0014.v8.ALT.zip肝機能: アラニンアミノ基転移酵素127 MB
hum0014.v8.APTT.zipその他の検査値: 活性化部分トロンボプラスチン時間126 MB
hum0014.v8.AST.zip肝機能: アスパラギン酸アミノ基転移酵素127 MB
hum0014.v8.Alb.zip血清蛋白質: アルブミン127 MB
hum0014.v8.BS.zip血糖・脂質関連: 血糖126 MB
hum0014.v8.BUN.zip腎機能: 尿素窒素127 MB
hum0014.v8.Baso.zip血球数: 好塩基球数126 MB
hum0014.v8.CK.zipその他の検査値: クレアチンキナーゼ127 MB
hum0014.v8.CRP.zipその他の検査値: C反応性蛋白126 MB
hum0014.v8.Ca.zip電解質: カルシウム126 MB
hum0014.v8.Cl.zip電解質: クロール127 MB
hum0014.v8.DBP.zip血圧: 拡張期血圧127 MB
hum0014.v8.EA.zip心エコー: E/A比124 MB
hum0014.v8.EF.zip心エコー: 左室駆出率124 MB
hum0014.v8.Eosino.zip血球数: 好酸球数126 MB
hum0014.v8.FS.zip心エコー: 左室内径短縮率123 MB
hum0014.v8.Fbg.zipその他の検査値: フィブリノーゲン124 MB
hum0014.v8.GGT.zip肝機能: ガンマグルタミルトランスフェラーゼ127 MB
hum0014.v8.HDL.zip血糖・脂質関連: HDLコレステロール126 MB
hum0014.v8.Hb.zip血球数: ヘモグロビン濃度127 MB
hum0014.v8.HbA1c.zip血糖・脂質関連: ヘモグロビンA1c126 MB
hum0014.v8.Ht.zip血球数: ヘマトクリット値127 MB
hum0014.v8.IVS.zip心エコー: 心室中隔壁厚123 MB
hum0014.v8.K.zip電解質: カリウム127 MB
hum0014.v8.LDH.zipその他の検査値: 乳酸脱水素酵素127 MB
hum0014.v8.LDL.zip血糖・脂質関連: LDLコレステロール126 MB
hum0014.v8.LVDd.zip心エコー: 左室拡張末期径123 MB
hum0014.v8.LVDs.zip心エコー: 左室収縮末期径123 MB
hum0014.v8.LVM.zip心エコー: 左室心筋重量124 MB
hum0014.v8.LVMI.zip心エコー: 左室心筋重量係数124 MB
hum0014.v8.Lym.zip血球数: リンパ球数126 MB
hum0014.v8.MAP.zip血圧: 平均血圧127 MB
hum0014.v8.MCH.zip血球数: 平均赤血球ヘモグロビン量127 MB
hum0014.v8.MCHC.zip血球数: 平均赤血球ヘモグロビン濃度127 MB
hum0014.v8.MCV.zip血球数: 平均赤血球容積127 MB
hum0014.v8.Mono.zip血球数: 単球数126 MB
hum0014.v8.NAP.zip血清蛋白質: 非アルブミン蛋白126 MB
hum0014.v8.Na.zip電解質: ナトリウム127 MB
hum0014.v8.Neutro.zip血球数: 好中球数126 MB
hum0014.v8.P.zip電解質: 無機リン126 MB
hum0014.v8.PP.zip血圧: 脈圧127 MB
hum0014.v8.PT.zipその他の検査値: プロトロンビン時間126 MB
hum0014.v8.PW.zip心エコー: 後壁厚123 MB
hum0014.v8.Plt.zip血球数: 血小板数127 MB
hum0014.v8.RBC.zip血球数: 赤血球数127 MB
hum0014.v8.RWT.zip心エコー: 相対的壁厚123 MB
hum0014.v8.SBP.zip血圧: 収縮期血圧127 MB
hum0014.v8.TBil.zip肝機能: 総ビリルビン127 MB
hum0014.v8.TC.zip血糖・脂質関連: 総コレステロール127 MB
hum0014.v8.TG.zip血糖・脂質関連: 中性脂肪127 MB
hum0014.v8.TP.zip血清蛋白質: 総蛋白127 MB
hum0014.v8.UA.zip腎機能: 尿酸127 MB
hum0014.v8.WBC.zip血球数: 白血球数127 MB
hum0014.v8.ZTT.zip肝機能: 硫酸亜鉛混濁試験124 MB
hum0014.v8.eGFR.zip腎機能: 推算糸球体濾過量127 MB
hum0014.v8.sCr.zip腎機能: 血清クレアチニン127 MB
hum0014_README_QTL_GWAS.htmlDictionary file36.0 KB

解析手法

Genotyping by array

材料と対象者
162,255名の58臨床検査値
試料説明
末梢血から抽出したgDNA
  • 組織
    末梢血
試料の入手元
N/A
実験方法
Genotyping by array
測定対象
N/A
プラットフォーム
Illumina HumanExome
Illumina HumanOmniExpress
Illumina HumanOmniExpressExome
参照ゲノム
GRCh37
QC・フィルタリング
GenotypingのQC：sample call rate < 0.98, SNV call rate < 0.99, HWE P < 1 x 10^-6
Imputation referenceのQC:
以下の条件に該当するSNVはreferenceから除外:
1) HWE P < 1 x 10^-6、2) MAF < 0.01
Imputation後のQC:
Imputation quality (Rsq) < 0.7 を除外。
インピュテーション
minimac [imputation（1000 genomes Phase I v3 ）]
解析方法
GenCall software（GenomeStudio）
バリアント数
常染色体: 5,961,600 SNVs
X染色体: 147,353 SNVs
利用ポリシー
NBDC データ共有ポリシー (JGAP000001)