データセット ID
NHA000061
- データの種類
- 情動脱力発作を伴うナルコレプシー患者409症例および対照健常者1562名のGWAS
- アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 70.7 MB
- ファイル形式
- XLSX
- ZIP
- 研究
- hum0072
- 公開日
- 2017-12-26
- 更新日
- 2017-12-26
- Secondary ID
- hum0072.v1.nrc.v1
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| hum0072.v1.nrc.v1.zip | 70.7 MB | ||
| hum0072_ | Dictionary file | 11.3 KB |
解析手法
Genotyping by array
- 材料と対象者
- 情動脱力発作を伴うナルコレプシー患者：409症例
対照健常者：1562名 - 健康状態混在
- 対象者数1971 (人数)
- 試料説明
- 末梢血から抽出したgDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Genotyping by array
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Genome-Wide Human SNP Array 6.0 Kit
- プラットフォーム
- Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0
- 参照ゲノム
- NCBI36
- QC・フィルタリング
- Sample call rate < 0.95、SNP call rate < 0.97、HWE P (in control) < 0.001
- 解析方法
- Birdseed (version 1.5.5)
- バリアント数
- 525,198 (HLA領域を除く常染色体のSNP)