データセット ID
JGAD001127
- データの種類
- NGS（scRNA-seq、scTCR-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 1.3 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0294
- 公開日
- 2026-11-02
- 更新日
- 2026-11-02
- DDBJ Search
- JGAD001127 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000966 (新しいタブで開きます)
解析手法
scRNA-seq + scTCR-seq
- 試料 / 対象者
- 切除不能進行・再発胃がん：12症例
切除不能進行・再発食道胃接合部がん：2症例
- 治療前（14検体：胃がん12、食道胃接合部がん2）、治療中（12検体：胃がん10、食道胃接合部がん2）、および増悪時（9検体：胃がん7、食道胃接合部がん2）の腫瘍組織 - 健康状態罹患
- 対象者数14 (人数)
- 対象集団日本人
- 疾患
- 食道胃接合部がん
- 胃がん
- 試料説明
- 腫瘍組織より単離した細胞から抽出したRNA
- 組織食道、胃
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 購入試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- scTCR-seq
scRNA-seq - 対象領域
- N/A
- 試薬キット
- Chromium Next GEM Single Cell 5' v2
- 断片化
- 酵素反応
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq X Plus
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 28 bp (read1)
90 bp (read2)