データセット ID
JGAD001038
- データの種類
- NGS（Exome、RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 325 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0563
- 公開日
- 2026-04-16
- 更新日
- 2026-04-16
- DDBJ Search
- JGAD001038 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000894 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 胃がん（ICD10：C16）：10症例
腫瘍組織と非腫瘍組織（末梢血）のペア：20検体 - 健康状態罹患
- 対象者数10 (人数)
- 疾患
- 胃がん
- 試料説明
- 腫瘍組織および末梢血から抽出したDNA
- 組織末梢血、胃
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V6
- 断片化
- 超音波断片化
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp
RNA-seq
- 材料と対象者
- 胃がん（ICD10：C16）：9症例
腫瘍組織：治療前 9検体、治療後 8検体 合計17検体 - 健康状態罹患
- 対象者数9 (人数)
- 疾患
- 胃がん
- 試料説明
- 腫瘍組織から抽出したRNA
- 組織胃
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit
- 断片化
- 化学的断片化
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 100 bp