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NBDC ヒトデータベース

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現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

JGAD001031

データの種類
NGS(scWGBS)
アクセス制限
制限公開(Type I)
総データ量
339 GB
ファイル形式
  • FASTQ
研究
hum0542
公開日
2026-03-10
更新日
2026-03-10

解析手法

scWGBS

材料と対象者
精巣腫瘍(ICD10:C629):3症例
非腫瘍組織(精巣腫瘍周辺の正常精巣):3検体(1検体につき10-20細胞程度)
  • 健康状態
    罹患
  • 対象者数
    3 (人数)
疾患
  • 精巣腫瘍
試料説明
正常精巣より分離した生殖細胞から抽出したDNA
  • 組織
    精巣
  • 腫瘍 / 非腫瘍
    非腫瘍
試料の入手元
N/A
実験方法
scWGBS
測定対象
N/A
試薬キット
NEBNext Multiplex Oligos for Illumina
断片化
N/A
プラットフォーム
Illumina NovaSeq X
リードタイプ
ペアエンド
リード長
100–500 bp