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NBDC ヒトデータベース

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現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

JGAD001027

データの種類
NGS(Target Capture)
アクセス制限
制限公開(Type I)
総データ量
3.6 GB
ファイル形式
  • BAM
研究
hum0555
公開日
2026-02-25
更新日
2026-02-25

このデータセットに紐づく非制限公開ファイル

ファイル名ラベルサイズURL のコピー
FoundationOneCDx_TechnicalInformation_FDALabel.pdf2.8 MB
FoundationOneCDx_TechnicalSpecifications_GeneList.pdf324遺伝子リスト283 KB
hum0555_FoundationOneCDx_GeneList.xlsx13.7 KB

解析手法

Targeted DNA sequencing

材料と対象者
子宮がん肉腫を発症したHBOC(ICD10:R798):1症例
腫瘍組織(FFPE検体):1検体
  • 健康状態
    罹患
  • 対象者数
    1 (人数)
疾患
  • 子宮がん肉腫を発症したHBOC
試料説明
腫瘍組織FFPE検体から抽出したDNA
  • 組織
    子宮
  • 腫瘍 / 非腫瘍
    腫瘍
試料の入手元
N/A
実験方法
Targeted DNA sequencing
測定対象
FoundationOne CDx(324遺伝子リスト)
試薬キット
FoundationOne CDx
断片化
上記プロトコルに準拠
プラットフォーム
Illumina NovaSeq 6000
マッピング
上記プロトコルに準拠
マッピング品質
上記プロトコルに準拠