データセット ID
JGAD001005
- データの種類
- NGS（scRNA-seq、snMultiome）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 981 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0197
- 公開日
- 2025-12-12
- 更新日
- 2025-12-12
- DDBJ Search
- JGAD001005 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000862 (新しいタブで開きます)
解析手法
scRNA-seq
- 材料と対象者
- 日本人男性気管支喘息（ICD10：J45.9）：3症例
- 健康状態罹患
- 対象者数3 (人数)
- 対象集団日本人
- 性別男性
- 疾患
- 日本人男性気管支喘息
- 試料説明
- PBMCから抽出したRNA
- 組織末梢血単核球 (PBMC)、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- scRNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Library Construction Kit C
Chromium GEM-X Single Cell 5' v3 - 断片化
- 酵素反応
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq X Plus
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp
snRNA-seq, snATAC-seq
- 材料と対象者
- 日本人男性COVID-19患者（ICD10：U07.1）：4症例
- 健康状態罹患
- 対象者数4 (人数)
- 対象集団日本人
- 性別男性
- 疾患
- 日本人男性COVID-19患者
- 試料説明
- PBMCから抽出したDNAおよびRNA
- 組織末梢血単核球 (PBMC)、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- scATAC-seq
scRNA-seq - 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Chromium Next GEM Chip J Single Cell Kit
Chromium Next GEM Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression - 断片化
- 酵素反応
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq X Plus
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp