データセット ID
JGAD000932
- データの種類
- NGS（scRNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 114 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- BAM
- 研究
- hum0508
- 公開日
- 2025-05-21
- 更新日
- 2025-05-21
- DDBJ Search
- JGAD000932 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000790 (新しいタブで開きます)
解析手法
scRNA-seq
- 材料と対象者
- 先天性無虹彩症（ICD10：Q131）：1症例
左眼角膜中央透明部および輪部の上皮細胞： 2検体 - 健康状態罹患
- 対象者数2 (検体数)
- 疾患
- 先天性無虹彩症 (Q131)
- 試料説明
- 上皮細胞から解離した単一細胞より抽出したRNA
- 組織Corneal epithelial cell、Limbal epithelial cell
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- scRNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Chromium Next GEM Single Cell 5' v2
- 断片化
- 上記キットに準拠
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 90 bp
- 参照ゲノム
- GRCh38
- マッピング
- Cell Ranger v7.1.0
- マッピング品質
- Reads Mapped to Genome: 93.5% (CE), 94.7% (LE)