データセット ID
JGAD000922
- データの種類
- NGS（RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 553 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0413
- 公開日
- 2025-04-18
- 更新日
- 2025-04-18
- DDBJ Search
- JGAD000922 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000780 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- アトピー性皮膚炎（ICD10：L20.9）：156症例（115症例はJGAS000628と重複）
皮膚：951検体（189検体はJGAS000628と重複）
乾癬（ICD10：L40.9）：18症例
皮膚：36検体
健常者：26名（16名はJGAS000628と重複）
皮膚：49検体（30検体はJGAS000628と重複） - 健康状態混在
- 対象者数271 (人数)
- 疾患
- アトピー性皮膚炎 (L209)
乾癬 (L409) - 試料説明
- 皮膚検体およびPBMC検体から抽出したRNA
- 組織末梢血単核球 (PBMC)、末梢血、皮膚
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- NEBNext Ultra RNA Library Prep Kit for Illumina
SureSelect Strand-Specific RNA Library Prep Kit - 断片化
- 高温条件下での2価陽イオンによる断片化
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 1500
Illumina HiSeq 2500 - リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 50 bp