2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
JGAD000865
- 公開日
- 2025-08-08
- 更新日
- 2026-02-20
- 研究
- hum0455
- データの種類
- NGS(WGS)
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- JGA Study
- JGAS000732
解析手法
WGS
- 材料と対象者
肺神経内分泌がん(ICD10: C34): 10＋10症例(筑波13例、自治医7例) 凍結検体 腫瘍組織: 10＋10検体 非腫瘍組織: 10＋10検体
- 実験方法
WGS
- プラットフォーム
Illumina [Novaseq 6000]
- 試料説明
凍結検体の腫瘍組織ならびに非腫瘍組織より抽出したDNA
- ライブラリ構築
TruSeq Nano DNA Library Prep kit
- 断片化
超音波断片化(Covaris)
- リードタイプ
Paired-end
- リード長
300 bp
- JGAデータセットAccession
- 総データ量
JGAD000865: 3.9 TB(fastq) JGAD000926: 3.9 TB(fastq)
- 利用ポリシー