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NBDC ヒトデータベース

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現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

JGAD000865

データの種類
NGS(WGS)
アクセス制限
制限公開(Type I)
総データ量
3.9 TB
ファイル形式
  • FASTQ
研究
hum0455
公開日
2025-08-08
更新日
2025-08-08

解析手法

WGS

材料と対象者
肺神経内分泌がん(ICD10:C34):10+10症例(筑波13例、自治医7例)
凍結検体 腫瘍組織:10+10検体
非腫瘍組織:10+10検体
  • 健康状態
    罹患
  • 対象者数
    20 (人数)
疾患
  • 肺神経内分泌がん
試料説明
凍結検体の腫瘍組織ならびに非腫瘍組織より抽出したDNA
  • 腫瘍 / 非腫瘍
    混在
試料の入手元
N/A
実験方法
WGS
測定対象
N/A
試薬キット
TruSeq Nano DNA Library Prep Kit
断片化
超音波断片化(Covaris)
プラットフォーム
Illumina NovaSeq 6000
リードタイプ
ペアエンド
リード長
300 bp