データセット ID
JGAD000854
- データの種類
- NGS（Exome、RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 10.0 GB
- ファイル形式
- BAM
- 研究
- hum0465
- 公開日
- 2025-04-10
- 更新日
- 2025-04-10
- DDBJ Search
- JGAD000854 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000721 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 急性混合型白血病（ICD10：C950）：1症例
骨髄検体より樹立した急性白血病細胞株：1検体 - 健康状態罹患
- 対象者数1 (人数)
- 疾患
- 急性混合型白血病
- 試料説明
- 細胞株から抽出したDNA
- 組織骨髄
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 細胞株
- JMPAL-1
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V7
- 断片化
- 超音波断片化
- プラットフォーム
- Illumina NextSeq 500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 200 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37
- マッピング
- Genomon2
- マッピング品質
- マッピングされた塩基数/参照ゲノムと異なる塩基数 10,837,871,473 / 32,768,322
- カバレッジ (深度)
- 30x (ratio = 0.945)
RNA-seq
- 材料と対象者
- 急性混合型白血病（ICD10：C950）：1症例
骨髄検体より樹立した急性白血病細胞株：1検体 - 健康状態罹患
- 対象者数1 (人数)
- 疾患
- 急性混合型白血病
- 試料説明
- 細胞株から抽出したRNA
- 組織骨髄
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 細胞株
- JMPAL-1
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq RNA Library Prep Kit
- 断片化
- TruSeq RNA Library Prep Kit
- プラットフォーム
- Illumina NextSeq 500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37
- マッピング
- Genomon-RNA
- マッピング品質
- N/A