データセット ID
JGAD000832
- データの種類
- 大腸がん617症例のWGSデータ
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 25.5 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0014
- 公開日
- 2024-05-27
- 更新日
- 2024-05-27
- DDBJ Search
- JGAD000832 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000699 (新しいタブで開きます)
解析手法
WGS
- 材料と対象者
- バイオバンク・ジャパン第1コホートおよび第2コホートに含まれる大腸がん(ICD10:C18、C19、C20):617症例
- 健康状態罹患
- 対象者数617 (人数)
- コホートBioBank Japan
- 疾患
- バイオバンク・ジャパン第1コホートおよび第2コホートに含まれる大腸がん
- 試料説明
- 末梢血から抽出したgDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WGS
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq Nano DNA Library Prep Kit
- 断片化
- 超音波断片化
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 125 bp