データセット ID
JGAD000823
- データの種類
- NGS（WGS）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 83.2 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0287
- 公開日
- 2024-04-26
- 更新日
- 2024-08-19
- DDBJ Search
- JGAD000823 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000690 (新しいタブで開きます)
解析手法
WGS
- 材料と対象者
- ヒトiPS細胞株: 1株
AGVTノックイン株(AG: TFAP2C-EGFP; VT: hVASA-tdTomato knock-ins)1, 2 - 対象者数1 (検体数)
- 試料説明
- iPS細胞から抽出したgDNA
- 組織iPS 細胞
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 細胞株
- NCL-CN
- 試料の入手元
- RxCell社から有償提供されたヒトiPS細胞株（NCL-CN）
- 実験方法
- WGS
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Ultra-Long DNA Sequencing Kit (SQK-ULK001)
- 断片化
- トランスポゼースを用いた断片化
- プラットフォーム
- Oxford Nanopore Technologies PromethION
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 80.7 kbp (N50 = run1)
96.3 kbp (run2)