データセット ID
JGAD000802
- データの種類
- NGS（Visium Spatial Gene Expression）、病理画像
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 244 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0440
- 公開日
- 2024-05-30
- 更新日
- 2025-12-11
- DDBJ Search
- JGAD000802 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000672 (新しいタブで開きます)
解析手法
Visium 空間トランスクリプトーム + 病理画像
- 材料と対象者
- 胸腺腫（ICD10：C37）：7症例、内2症例は重症筋無力症（ICD10：G700）を合併
腫瘍組織：8検体
（重複1例については、同一組織より2箇所のサンプリングを施行した）
胸腺過形成（ICD10：E32.0）：2症例、重症筋無力症（ICD10：G700）を合併
胸腺過形成組織：2検体 - 健康状態罹患
- 対象者数9 (人数)
- 疾患
- 胸腺腫 (C37)
重症筋無力症 (G700)
胸腺過形成 (E320) - 試料説明
- 腫瘍組織または胸腺過形成組織より抽出したRNA
- 組織胸腺
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Histological image
Spatial transcriptomics - 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Visium Spatial Gene Expression
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- MGI DNBSEQ-G400
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- R1: 28 bp
R2: 100 bp