データセット ID
JGAD000792
- データの種類
- NGS（Target Capture）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 2.7 TB
- ファイル形式
- BAM
- GZIP
- 研究
- hum0418
- 公開日
- 2025-04-09
- 更新日
- 2025-04-09
- DDBJ Search
- JGAD000792 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000662 (新しいタブで開きます)
解析手法
Targeted DNA sequencing
- 材料と対象者
- 抗悪性腫瘍薬による治療を予定しているがん患者（ICD10：C00-D48）：507名（1018検体）
腫瘍組織および非腫瘍組織（末梢血）
507名のうち、1名は2がん種（重複がん）の2検体、1名は原発巣と転移巣の2検体 - 健康状態罹患
- 対象者数507 (人数)
- 疾患
- 抗悪性腫瘍薬による治療を予定しているがん患者
- 試料説明
- がん患者の腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Targeted DNA sequencing
- 測定対象
- NCCオンコパネル検査（114遺伝子）
- 試薬キット
- KAPA Hyper Prep Kit
SureSelect XT Reagent Kit - 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina MiSeq
Illumina NextSeq - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 151 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37