データセット ID
JGAD000784
- データの種類
- NGS(WGS)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 271 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0426
- 公開日
- 2024-08-02
- 更新日
- 2024-08-02
- DDBJ Search
- JGAD000784 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000654 (新しいタブで開きます)
解析手法
WGS
- 材料と対象者
- 遺伝性腫瘍(ICD10:C00-C97):33 症例
末梢血(正常白血球):33 検体 - 健康状態罹患
- 対象者数33 (人数)
- 疾患
- 遺伝性腫瘍
- 試料説明
- 末梢血から抽出したDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WGS
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Ligation Sequencing Kit (SQK-LSK110)
Ligation Sequencing Kit (SQK-LSK114) - 断片化
- g-TUBE(Covaris)
- プラットフォーム
- Oxford Nanopore Technologies GridION
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 600 bp (N50・約)
ターゲット領域: 9000 bp (N50・約)