データセット ID
JGAD000751
- データの種類
- NGS（Target Capture）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 40.8 GB
- ファイル形式
- BAM
- 研究
- hum0403
- 公開日
- 2023-07-01
- 更新日
- 2023-07-01
- DDBJ Search
- JGAD000751 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000622 (新しいタブで開きます)
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| AVENIO_ | 77遺伝子 | 10.7 KB |
解析手法
Targeted DNA sequencing
- 材料と対象者
- 転移性尿路上皮がん（ICD10：C65、C66、C67.9）：16症例
免疫チェックポイント阻害剤投与前の血漿：16検体
免疫チェックポイント阻害剤投与後の血漿：9検体 - 健康状態罹患
- 対象者数25 (混在)
- 疾患
- 転移性尿路上皮がん (C65, C66, C679)
- 試料説明
- 血漿のセルフリーDNA
- 組織cfDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Targeted DNA sequencing
- 測定対象
- 77遺伝子
- 試薬キット
- AVENIO ctDNA Expanded Kit
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina NextSeq 500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 151 bp
- 参照ゲノム
- GRCh38
- マッピング
- AVENIO ctDNA Analysis Software Version 2.0.0
- マッピング品質
- 99.99997595
- カバレッジ (深度)
- 7243x