データセット ID
JGAD000701
- データの種類
- NGS（Exome）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 3.8 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0338
- 公開日
- 2022-11-24
- 更新日
- 2022-11-24
- DDBJ Search
- JGAD000701 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000575 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- ピロリ菌未感染胃がん（ICD10：C169）：27症例
腫瘍組織：27検体、非腫瘍組織：27検体
ピロリ菌感染胃がん（ICD10：C169）：36症例
腫瘍組織：36検体、非腫瘍組織：36検体 - 健康状態罹患
- 対象者数63 (人数)
- 疾患
- ピロリ菌未感染胃がん (C169)
ピロリ菌感染胃がん (C169) - 試料説明
- 腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V4
SureSelect Human All Exon V5 + lincRNA - 断片化
- 超音波断片化（Covaris E220）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp