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NBDC ヒトデータベース

カートに入れたデータセットはありません。

システムメンテナンスに伴い、以下の日程で、NBDCヒトデータベース申請システムならびにヒトデータ審査委員会による審査が停止いたします。
停止期間:2026年10月5日(月) 9:00 ~ 10月7日(水) 15:00
ご迷惑をおかけしますが、どうぞ宜しくお願いいたします。

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

JGAD000659

データの種類
メタゲノム
アクセス制限
制限公開(Type I)
総データ量
1.3 GB
ファイル形式
  • FASTQ
  • TXT
研究
hum0351
公開日
2022-09-01
更新日
2022-09-01

解析手法

Metagenomics (16S rRNA)

材料と対象者
もやもや病(ICD10: I675):27症例
非もやもや脳血管障害:7症例
対照健常者:15名
  • 健康状態
    混在
  • 対象者数
    49 (人数)
疾患
もやもや病 (I675)
試料説明
便より抽出したDNA
  • 組織
    便
  • 腫瘍 / 非腫瘍
    非腫瘍
試料の入手元
N/A
実験方法
16S rRNA sequencing
測定対象
V3-V4
試薬キット
2-step tailed PCR (Ex Taq HS)
断片化
N/A
プラットフォーム
Illumina MiSeq
リードタイプ
ペアエンド
リード長
300 bp
QC・フィルタリング
・FASTXToolkitでプライマーの除去
・sickleで低品質の除去
解析方法
Greengene (ver.13_8)