データセット ID
JGAD000659
- データの種類
- メタゲノム
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 1.3 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- TXT
- 研究
- hum0351
- 公開日
- 2022-09-01
- 更新日
- 2022-09-01
- DDBJ Search
- JGAD000659 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000540 (新しいタブで開きます)
解析手法
Metagenomics (16S rRNA)
- 材料と対象者
- もやもや病(ICD10: I675):27症例
非もやもや脳血管障害:7症例
対照健常者:15名 - 健康状態混在
- 対象者数49 (人数)
- 疾患
- もやもや病 (I675)
- 試料説明
- 便より抽出したDNA
- 組織便
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- 16S rRNA sequencing
- 測定対象
- V3-V4
- 試薬キット
- 2-step tailed PCR (Ex Taq HS)
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina MiSeq
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 300 bp
- QC・フィルタリング
- ・FASTXToolkitでプライマーの除去
・sickleで低品質の除去 - 解析方法
- Greengene (ver.13_8)