データセット ID
JGAD000652
- データの種類
- NGS(WGS)
NGS(RNA-seq) - アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 9.1 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0344
- 公開日
- 2022-08-06
- 更新日
- 2022-08-06
- DDBJ Search
- JGAD000652 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000533 (新しいタブで開きます)
解析手法
WGS
- 材料と対象者
- 終末期の腎臓がん (ICD10:C64):38症例
腫瘍組織:38検体
非腫瘍組織もしくは末梢血:37検体 - 健康状態罹患
- 対象者数38 (人数)
- 疾患
- 終末期の腎臓がん (C64)
- 試料説明
- 終末期の腎臓がんの腫瘍組織ならびに非腫瘍組織もしくは末梢血から抽出したDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WGS
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- MGIEasy DNA Library Prep Kit
NEBNext Ultra II FS DNA Module - 断片化
- 酵素反応
- プラットフォーム
- MGI DNBSEQ-G400
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp
150 bp
RNA-seq
- 材料と対象者
- 終末期の腎臓がん (ICD10:C64):26症例(WGSも実施)
腫瘍組織:26検体 - 健康状態罹患
- 対象者数26 (人数)
- 疾患
- 終末期の腎臓がん (C64)
- 試料説明
- 終末期の腎臓がんの腫瘍組織から抽出したRNA
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit
- 断片化
- 熱処理
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 126 bp