データセット ID
JGAD000647
- データの種類
- NGS（scRNA-seq）
NGS（ATAC-seq） - アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 76.6 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0345
- 公開日
- 2022-08-09
- 更新日
- 2022-08-09
- DDBJ Search
- JGAD000647 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000528 (新しいタブで開きます)
解析手法
scRNA-seq
- 材料と対象者
- 健常者：2名
- 健康状態健常
- 対象者数2 (人数)
- 試料説明
- 健常者2名の臍帯血を混合し単離したCD34陽性細胞から抽出したRNA
- 組織CD34+ cell、臍帯血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- scRNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Chromium Next GEM Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression
- 断片化
- 酵素反応
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 118 bp
ATAC-seq
- 材料と対象者
- 健常者：2名
- 健康状態健常
- 対象者数2 (人数)
- 試料説明
- 健常者2名の臍帯血を混合し単離したCD34陽性細胞から抽出したDNA
- 組織臍帯血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- ATAC-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Chromium Next GEM Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression
- 断片化
- 酵素反応
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リード長
- 99 bp