データセット ID
JGAD000627
- データの種類
- NGS（Target Capture）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 7.3 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0328
- 公開日
- 2025-04-10
- 更新日
- 2025-04-10
- DDBJ Search
- JGAD000627 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000509 (新しいタブで開きます)
解析手法
Targeted DNA sequencing
- 材料と対象者
- 前立腺がん（ICD10：C61）：129症例
- 健康状態罹患
- 対象者数129 (人数)
- 疾患
- 前立腺がん (C61)
- 試料説明
- 末梢血から抽出したDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Targeted DNA sequencing
- 測定対象
- DNA修復に関わる27遺伝子（APC, ATM, BARD1, BMPR1A, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDH1, CDK4, CDKN2A, CHEK2, EPCAM, HOXB13, MLH1, MSH2, MSH6, MUTYH, NBN, NF1, PALB2, PMS2, PTEN, RAD51C, RAD51D, SMAD4, STK11, TP53）
- 試薬キット
- KAPA HiFi DNA Polymerase
2X Platinum Multiplex PCR Master Mix - 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp