データセット ID
JGAD000626
- データの種類
- 特発性過眠症のSNPアレイデータ
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 6.6 GB
- ファイル形式
- CEL
- 研究
- hum0264
- 公開日
- 2022-02-21
- 更新日
- 2022-02-21
- DDBJ Search
- JGAD000626 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000508 (新しいタブで開きます)
解析手法
Genotyping by array
- 材料と対象者
- 特発性過眠症（ICD10：G47.11）：96症例
（オレキシン変異陽性11例、オレキシン変異陰性85例） - 健康状態罹患
- 対象者数96 (人数)
- 疾患
- 特発性過眠症 (G471)
- 試料説明
- 末梢血から抽出したDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Genotyping by array
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Genome-Wide Human SNP Array 6.0 Kit
- プラットフォーム
- Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0
- 参照ゲノム
- GRCh37
- QC・フィルタリング
- SNP call rate < 0.97、HWE P < 0.001、MAF < 0.05、non-autosomal chromosomes
- 解析方法
- GeneChip Operating Software (GCOS)、Genotyping Console 4.0
- バリアント数
- 487,321 SNPs