データセット ID
JGAD000482
- データの種類
- NGS（Target Capture）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 814 GB
- ファイル形式
- BAM
- 研究
- hum0301
- 公開日
- 2021-11-26
- 更新日
- 2021-11-26
- DDBJ Search
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- JGA Study
- JGAS000368 (新しいタブで開きます)
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| 464genes.xlsx | 464遺伝子 | 325 KB |
解析手法
Targeted DNA sequencing
- 材料と対象者
- 乳がん（ICD10：C50.9）：26症例（計329検体）
腫瘍組織 凍結検体：9症例（23検体）
腫瘍組織 FFPE検体：19症例（37検体）
正常組織 凍結検体：14症例（57検体）
正常組織 FFPE検体：22症例（212検体） - 健康状態罹患
- 対象者数26 (人数)
- 疾患
- 乳がん
- 試料説明
- 腫瘍組織および正常組織（凍結検体、FFPE）から抽出したDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Targeted DNA sequencing
- 測定対象
- 464遺伝子（Todai OncoPanel）
- 試薬キット
- MGIEasy Universal Library Conversion Kit
SureSelect Custom
Twist Custom Panels - 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
Illumina NovaSeq 6000
MGI DNBSEQ-G400 - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 124–151 bp
- 参照ゲノム
- GRCh38