現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

JGAD000432

データの種類: NGS（WGS）
NGS（scRNA-seq）
NGS（TCR-seq）
NGS（BCR-seq）
CyTOF
アクセス制限: 制限公開（Type I）
総データ量: 2.2 TB
ファイル形式: FASTQ
TXT
研究: hum0290
公開日: 2022-02-17
更新日: 2022-02-17
DDBJ Search: JGAD000432 (新しいタブで開きます)
JGA Study: JGAS000321 (新しいタブで開きます)

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Fluidimg_MarkerList.xlsx	免疫応答に関する30蛋白質	10.1 KB
JPN-Maxpar-Direct-Immune-Profiling-System-flyer-FLDM-A4-2page.pdf		1.0 MB
Maxpar-Direct-Immune-Profiling-System-flyer-FLDM-400246-Rev04.pdf		1.9 MB

解析手法

WGS

材料と対象者: 健常者：2名（2検体）; 健康状態
健常
対象者数
2 (人数)
試料説明: 末梢血から抽出したDNA; 組織
末梢血
腫瘍 / 非腫瘍
非腫瘍
試料の入手元: N/A
実験方法: WGS
測定対象: N/A
試薬キット: Ligation Sequencing Kit (SQK-LSK109)
TruSeq Nano DNA Library Prep Kit
断片化: Illumina：超音波断片化（Covaris）
Nanopore：-
プラットフォーム: Illumina NovaSeq 6000
Oxford Nanopore Technologies PromethION
リードタイプ: 混在
リード長: Illumina: 300 bp
利用ポリシー: NBDC データ共有ポリシー (JGAP000001)

scRNA-seq

材料と対象者: 健常者：7名（57検体）; 健康状態
健常
対象者数
7 (人数)
試料説明: 末梢血より単離した細胞から抽出したRNA; 組織
末梢血
腫瘍 / 非腫瘍
非腫瘍
試料の入手元: N/A
実験方法: scRNA-seq
測定対象: N/A
試薬キット: Chromium Next GEM Single Cell V(D)J v1.1
断片化: 酵素反応
プラットフォーム: 10x Genomics Chromium
リードタイプ: シングルエンド
リード長: 91 bp
利用ポリシー: NBDC データ共有ポリシー (JGAP000001)

TCR-seq

材料と対象者: 健常者：7名（57検体）; 健康状態
健常
対象者数
7 (人数)
試料説明: 末梢血より単離した細胞から抽出したRNA; 組織
末梢血
腫瘍 / 非腫瘍
非腫瘍
試料の入手元: N/A
実験方法: TCR-seq
測定対象: N/A
試薬キット: Chromium Next GEM Single Cell V(D)J v1.1
断片化: 酵素反応
プラットフォーム: 10x Genomics Chromium
リードタイプ: シングルエンド
リード長: 91 bp
利用ポリシー: NBDC データ共有ポリシー (JGAP000001)

BCR-seq

材料と対象者: 健常者：7名（35検体）; 健康状態
健常
対象者数
7 (人数)
試料説明: 末梢血より単離した細胞から抽出したRNA; 組織
末梢血
腫瘍 / 非腫瘍
非腫瘍
試料の入手元: N/A
実験方法: BCR-seq
測定対象: N/A
試薬キット: Chromium Next GEM Single Cell V(D)J v1.1
断片化: 酵素反応
プラットフォーム: 10x Genomics Chromium
リードタイプ: シングルエンド
リード長: 91 bp
利用ポリシー: NBDC データ共有ポリシー (JGAP000001)

Mass cytometry (CyTOF)

材料と対象者: 健常者：6名（30検体）; 健康状態
健常
対象者数
6 (人数)
試料説明: 末梢血から単離した細胞; 組織
末梢血
腫瘍 / 非腫瘍
非腫瘍
実験変数: 個別変異、ワクチン接種後、ワクチンの種類（インフルエンザ、SARS-CoV-2）
試料の入手元: N/A
実験方法: CyTOF
測定対象: 免疫応答に関する30蛋白質
試薬キット: Maxpar Direct Immune Profiling Assay
プラットフォーム: Fluidigm Helios
解析方法: Maxpar Pathsetter （Cat. #401018）
表現型データの有無: あり
利用ポリシー: NBDC データ共有ポリシー (JGAP000001)