データセット ID
JGAD000424
- データの種類
- NGS（Exome）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 156 GB
- ファイル形式
- BAM
- 研究
- hum0275
- 公開日
- 2021-07-19
- 更新日
- 2021-07-19
- DDBJ Search
- JGAD000424 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000313 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 胃がん既往の無いヘリコバクターピロリ未感染者：9名、45検体
正常胃粘膜検体：36検体（2か所より採取した検体を2つに分けた各4検体）
末梢血：9検体（各1検体） - 健康状態健常
- 対象者数9 (人数)
- 試料説明
- 胃粘膜および末梢血から抽出したDNA
- 組織末梢血、胃
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Lotus DNA Library Prep Kit
- 断片化
- 酵素反応
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp
- 参照ゲノム
- GRCh38