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NBDC ヒトデータベース
JGAD000424
公開日
2021-07-19

更新日
2021-08-16

研究
hum0275

データの種類
NGS(Exome)

アクセス制限
制限公開(Type I)

JGA Study
JGAS000313

解析手法

WES

材料と対象者

胃がん既往の無いヘリコバクターピロリ未感染者: 9名、45検体 正常胃粘膜検体: 36検体(2か所より採取した検体を2つに分けた各4検体) 末梢血: 9検体(各1検体)

実験方法

Exome

プラットフォーム

Illumina [NovaSeq 6000]

試料説明

胃粘膜および末梢血から抽出したDNA

ライブラリ構築

IDT Lotus DNA Library Prep Kit

断片化

酵素反応

リードタイプ

Paired-end

リード長

150 bp

JGAデータセットAccession
総データ量

156.4 GB(bam [ref: GRCh38])

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