データセット ID
JGAD000394
- データの種類
- NGS(Target Capture、Target RNA-seq)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 1.7 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0271
- 公開日
- 2021-05-10
- 更新日
- 2021-05-10
- DDBJ Search
- JGAD000394 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000288 (新しいタブで開きます)
解析手法
Targeted DNA sequencing
- 材料と対象者
- 神経線維腫症1型(ICD10:Q85.0):20症例
- 健康状態罹患
- 対象者数20 (人数)
- 疾患
- 神経線維腫症1型 (Q850)
- 試料説明
- 末梢血から抽出したDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Targeted DNA sequencing
- 測定対象
- NF1遺伝子
- 試薬キット
- Nextera DNA Flex Library Prep
- 断片化
- Nextera DNA Flex Library Prep
- プラットフォーム
- Illumina MiSeq
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 400 bp
Target RNA-seq
- 材料と対象者
- 神経線維腫症1型(ICD10:Q85.0):20症例
- 健康状態罹患
- 対象者数20 (人数)
- 疾患
- 神経線維腫症1型 (Q850)
- 試料説明
- 末梢血から抽出したmRNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- NF1遺伝子
- 試薬キット
- Nextera DNA Flex Library Prep
SMART-Seq HT Kit - 断片化
- Nextera DNA Flex Library Prep
- プラットフォーム
- Illumina MiSeq
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 400 bp