データセット ID
JGAD000382
- データの種類
- NGS（Target Capture）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 116 GB
- ファイル形式
- BAM
- 研究
- hum0245
- 公開日
- 2022-10-26
- 更新日
- 2022-10-26
- DDBJ Search
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- JGA Study
- JGAS000276 (新しいタブで開きます)
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| hum0245_ | 110遺伝子 | 10.7 KB |
解析手法
Targeted DNA sequencing
- 材料と対象者
- フィラデルフィア染色体陰性ALL（ICD10：C91.0）：46症例
- 健康状態罹患
- 対象者数46 (人数)
- 年齢層混在
- 疾患
- フィラデルフィア染色体陰性ALL (C910)
- 試料説明
- 白血病細胞から抽出したDNA
- 組織Leukemia cell
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Targeted DNA sequencing
- 測定対象
- 110遺伝子
- 試薬キット
- SureSelect XT Low Input
- 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 125 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37
- マッピング
- bwa
- マッピング品質
- > 20
- カバレッジ (深度)
- 570x