データセット ID
JGAD000363
- データの種類
- メタゲノム
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 439 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0197
- 公開日
- 2020-11-27
- 更新日
- 2020-11-27
- DDBJ Search
- JGAD000363 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000260 (新しいタブで開きます)
解析手法
Metagenomics
- 材料と対象者
- 日本人集団：95＋103＋227＋30＋136 名
炎症性腸疾患症例
潰瘍性大腸炎 （ICD10：K519）：35症例
クローン病 （ICD10：K509）：39症例
対照健常者：40名
日本人集団：103名 - 健康状態混在
- 対象者数705 (人数)
- 対象集団日本人
- 疾患
- 潰瘍性大腸炎
- クローン病
- 試料説明
- 便より抽出したDNA
- 組織腸内細菌叢
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Metagenomics
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- KAPA Hyper Prep Kit
- 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 3000
Illumina NovaSeq 6000 - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp
- 表現型データの有無
- あり