データセット ID
JGAD000344
- データの種類
- NGS（Exome）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 840 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0216
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000344 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000244 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 胃がん（ICD10：C16）：26症例
肺がん（ICD10：C34）：9症例
悪性黒色腫（ICD10：C43）：5症例
（腫瘍組織、非腫瘍組織のペア） - 健康状態罹患
- 対象者数40 (人数)
- 疾患
- 胃がん
- 肺がん
- 悪性黒色腫
- 試料説明
- 胃がん、肺がんおよび悪性黒色腫の腫瘍組織と非腫瘍組織から抽出したDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- NEBNext Ultra DNA Library Prep Kit for Illumina
- 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 120–150 bp