データセット ID
JGAD000326
- データの種類
- NGS（Target Capture）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 94.4 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- VCF
- TBI
- 研究
- hum0223
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-11-18
- DDBJ Search
- JGAD000326 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000232 (新しいタブで開きます)
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| hum0223_ | 126遺伝子 | 48.7 KB |
解析手法
Targeted DNA sequencing
- 材料と対象者
- 多発性骨髄腫（ICD10：C90.0）：7症例
初発時、再発時の骨髄穿刺吸引検体（骨髄腫細胞）：計30検体 - 健康状態罹患
- 対象者数7 (人数)
- 疾患
- 多発性骨髄腫 (C900)
- 試料説明
- 骨髄腫細胞より抽出したDNA
- 組織骨髄、Plasma cell
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Targeted DNA sequencing
- 測定対象
- 126遺伝子
- 試薬キット
- Ion AmpliSeq Library Kit
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Thermo Fisher Scientific Ion Proton
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 3–1754 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37
- マッピング
- TMAP
- リード重複除去
- N/A
- QC・フィルタリング
- TaqMan® Assay
- 解析方法
- Variant Caller
- カバレッジ (深度)
- 2815x