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NBDC ヒトデータベース
JGAD000302
公開日
2020-09-28

更新日
2021-03-29

研究
hum0216

データの種類
NGS(Exome)

アクセス制限
制限公開(Type I)

JGA Study
JGAS000216

解析手法

WES

材料と対象者

肺腺がん(ICD10: C349): 17症例 胃がん(ICD10: C16): 23症例 (腫瘍組織、非腫瘍組織のペア)

実験方法

Exome

プラットフォーム

Illumina [HiSeq 2500]

試料説明

肺腺がんおよび胃がんの腫瘍組織と非腫瘍組織から抽出したDNA

ライブラリ構築

SureSelect XT Human All Exon system

断片化

超音波断片化(Covaris)

リードタイプ

Paired-end

リード長

100 bp x 2

JGAデータセットAccession

JGAD000302(肺腺がん)

総データ量

JGAD000302: 230 GB (fastq) JGAD000327: 742 GB (fastq)

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