データセット ID
JGAD000300
- データの種類
- NGS（Exome）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 138 GB
- ファイル形式
- BAM
- 研究
- hum0208
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-11-18
- DDBJ Search
- JGAD000300 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000214 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- ・両側外耳道がん（ICD10：C442）：1症例
（左右外耳道原発巣＋再発巣：3検体）
・片側外耳道がん（ICD10：C442）：9症例
（外耳道原発巣：9検体）
・各症例の末梢血単核球（PBMC）：10検体 - 健康状態罹患
- 対象者数22 (検体数)
- 疾患
- 両側外耳道がん (C442)
片側外耳道がん (C442) - 試料説明
- 外耳道がんの腫瘍組織と末梢血単核球から抽出したDNA
- 組織External auditory canal、末梢血単核球 (PBMC)、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V6
- 断片化
- 上記キットに準拠
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq X
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 100 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37