データセット ID
JGAD000297
- データの種類
- NGS（Exome）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 31.0 GB
- ファイル形式
- BAM
- 研究
- hum0210
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000297 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000211 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 急性骨髄性白血病と縦隔胚細胞腫瘍の合併症（ICD10：C920, C383）：1症例（3検体）
骨髄穿刺による骨髄液の腫瘍細胞を含む単核球分画：1検体
縦隔胚細胞腫瘍の腫瘍組織：1検体
口腔粘膜（非腫瘍組織）：1検体 - 健康状態罹患
- 対象者数3 (検体数)
- 疾患
- 急性骨髄性白血病と縦隔胚細胞腫瘍の合併症
- 試料説明
- 腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したDNA
- 組織骨髄、頬粘膜、Mediastinum
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V6
- 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina NextSeq 500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37