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NBDC ヒトデータベース
JGAD000297
公開日
2020-09-28

更新日
2026-07-30

研究
hum0210

データの種類
NGS(Exome)

アクセス制限
制限公開(Type I)

JGA Study
JGAS000211

解析手法

WES

材料と対象者

急性骨髄性白血病と縦隔胚細胞腫瘍の合併症(ICD10: C920, C383): 1症例(3検体) 骨髄穿刺による骨髄液の腫瘍細胞を含む単核球分画: 1検体 縦隔胚細胞腫瘍の腫瘍組織: 1検体 口腔粘膜(非腫瘍組織): 1検体

実験方法

Exome

プラットフォーム

Illumina [NextSeq 500]

試料説明

腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したDNA

ライブラリ構築

SureSelect Human All Exon v6

断片化

超音波断片化(Covaris)

リードタイプ

Paired-end

リード長

150 bp

JGAデータセットAccession
総データ量

28 GB(bam [ref: hg19])

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