データセット ID
JGAD000283
- データの種類
- NGS(RNA-seq)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 52.0 GB
- ファイル形式
- BAM
- 研究
- hum0199
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-11-18
- DDBJ Search
- JGAD000283 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000198 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- 前立腺がん(ICD10:C61):25症例
原発巣の腫瘍組織+非腫瘍組織:6症例
原発巣の腫瘍組織のみ:13症例
再発巣の腫瘍組織:4症例
再発かつ転移巣の腫瘍組織:2症例 - 健康状態罹患
- 対象者数25 (人数)
- 疾患
- 前立腺がん (C61)
- 試料説明
- 手術で摘出した腫瘍組織もしくは非腫瘍組織から抽出したtotal RNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq RNA Library Prep Kit
- 断片化
- 上記キットに準拠
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 50 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37