データセット ID
JGAD000243
- データの種類
- NGS（ChIP-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 70.6 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- XLSX
- 研究
- hum0091
- 公開日
- 2021-03-12
- 更新日
- 2021-03-12
- DDBJ Search
- JGAD000243 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000165 (新しいタブで開きます)
解析手法
ChIP-seq
- 材料と対象者
- 胃粘膜から腺管分離法で純化した表層粘液細胞 （腺窩上皮細胞）14種類（正常：14細胞）
- 健康状態健常
- 対象者数14 (検体数)
- 試料説明
- 胃粘膜から腺管分離法で純化した表層粘液細胞より抽出したDNA
- 組織Foveolar epithelial cell
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- ChIP-seq
- 測定対象
- N/A
- 断片化
- 超音波断片化（BRANSON SLPe, amplitude 40%, on 30 sec and off 30 sec, 10 cycles, on ice）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 36 bp