データセット ID
JGAD000138
- データの種類
- NGS（RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 92.9 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0125
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-11-18
- DDBJ Search
- JGAD000138 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000127 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- クローン病（ICD10：K50）：3症例
大腸がん：4症例（非腫瘍組織） - 健康状態罹患
- 対象者数7 (人数)
- 疾患
- クローン病 (K50)
- 試料説明
- クローン病の病変部および大腸がんの切除切片の中の非腫瘍組織（正常大腸組織）について、分離マーカーの違い（CD14-CD11c- / CD14-CD11c- / CD14+CD11c-CD163low）によって単離した細胞から抽出したRNA
- 組織結腸
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- KAPA Frag
KAPA Library Preparation Kit - 断片化
- KAPA Frag
- プラットフォーム
- Thermo Fisher Scientific Ion S5
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 150 bp (平均)