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NBDC ヒトデータベース

カートに入れたデータセットはありません。

システムメンテナンスに伴い、以下の日程で、NBDCヒトデータベース申請システムならびにヒトデータ審査委員会による審査が停止いたします。
停止期間:2026年10月5日(月) 9:00 ~ 10月7日(水) 15:00
ご迷惑をおかけしますが、どうぞ宜しくお願いいたします。

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

JGAD000135

データの種類
NGS(CAGE-seq)
サンガー法
アクセス制限
制限公開(Type I)
総データ量
5.8 GB
ファイル形式
  • FASTQ
  • FASTA
研究
hum0118
公開日
2020-09-28
更新日
2020-11-18

解析手法

CAGE-seq

材料と対象者
子宮体がん(ICD10:C54.1)の摘出組織(腫瘍組織):15検体
  • 健康状態
    罹患
  • 対象者数
    15 (検体数)
疾患
子宮体がん (C541)
試料説明
子宮体がん摘出組織の腫瘍組織から抽出したRNA
  • 組織
    子宮内膜
  • 腫瘍 / 非腫瘍
    腫瘍
試料の入手元
N/A
実験方法
CAGE-seq
測定対象
N/A
断片化
N/A
プラットフォーム
Illumina HiSeq 2500
リードタイプ
シングルエンド
リード長
47 bp

Sanger sequencing

材料と対象者
子宮体がん(ICD10:C54.1)の摘出組織(腫瘍組織):3検体(1検体はCAGE-seqと重複)
  • 健康状態
    罹患
  • 対象者数
    3 (検体数)
疾患
子宮体がん (C541)
試料説明
子宮体がん摘出組織の腫瘍組織から抽出したRNAを逆転写したcDNA
  • 腫瘍 / 非腫瘍
    腫瘍
試料の入手元
N/A
実験方法
Sanger sequencing
測定対象
TACC2(chr10:123,748,689-124,014,057 [ref: hg19])
試薬キット
BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit
プラットフォーム
Thermo Fisher Scientific 3500 Genetic Analyzer
参照ゲノム
GRCh37