データセット ID
JGAD000109
- データの種類
- NGS（Exome）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 4.0 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0059
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000109 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000104 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 卵巣がん：65症例（合計148検体）
正常組織：67検体
腫瘍組織：81検体 - 健康状態罹患
- 対象者数65 (人数)
- 試料説明
- 正常組織と原発巣・再発巣の腫瘍組織から抽出したDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V4
SureSelect Human All Exon V5 + lincRNA - 断片化
- 超音波断片化（Covaris E220）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp
- 表現型データの有無
- あり