データセット ID
JGAD000082
- データの種類
- NGS(PBAT-seq)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 1.8 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- XLSX
- 研究
- hum0091
- 公開日
- 2021-03-12
- 更新日
- 2021-03-12
- DDBJ Search
- JGAD000082 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000082 (新しいタブで開きます)
解析手法
PBAT-seq
- 材料と対象者
- 胃粘膜から腺管分離法で純化した表層粘液細胞 (腺窩上皮細胞)14種類(正常:14細胞)
- 健康状態健常
- 対象者数14 (検体数)
- 試料説明
- 胃粘膜から腺管分離法で純化した表層粘液細胞より抽出したDNA
- 組織Foveolar epithelial cell
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- PBAT-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Post-Bisulfite Adaptor-Tagging (PBAT)
- 断片化
- Post-bisulfite adaptor-tagging(PBAT)法による(Bisulfite変換に伴うDNA切断)
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 100 bp