データセット ID
JGAD000080
- データの種類
- NGS(RNA-seq)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 98.5 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- XLSX
- 研究
- hum0090
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-11-18
- DDBJ Search
- JGAD000080 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000080 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- 大腸(右半結腸、左半結腸、直腸)粘膜から腺管分離法で純化した吸収上皮細胞12種類(正常:12細胞)
- 健康状態健常
- 対象者数12 (検体数)
- 試料説明
- 大腸(右半結腸、左半結腸、直腸)粘膜から腺管分離法で純化した吸収上皮細胞より抽出したRNA
- 組織Colorectal mucosa absorptive epithelial cell
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Strand-Specific RNA Library Prep Kit
- 断片化
- 二価陽イオンと温度(94℃) によるRNAの断片化
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp