データセット ID
JGAD000079
- データの種類
- NGS(ChIP-seq)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 92.3 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- XLSX
- 研究
- hum0090
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-11-18
- DDBJ Search
- JGAD000079 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000079 (新しいタブで開きます)
解析手法
ChIP-seq
- 材料と対象者
- 大腸(右半結腸、左半結腸、直腸)粘膜から腺管分離法で純化した吸収上皮細胞12種類(正常:12細胞)
- 健康状態健常
- 対象者数12 (検体数)
- 試料説明
- 大腸(右半結腸、左半結腸、直腸)粘膜から腺管分離法で純化した吸収上皮細胞より抽出したDNA
- 組織Colorectal mucosa absorptive epithelial cell
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- ChIP-seq
- 測定対象
- N/A
- 断片化
- 超音波断片化(BRANSON SLPe, amplitude 40%, on 30 sec and off 30 sec, 10 cycles, on ice)
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 36 bp