データセット ID
JGAD000078
- データの種類
- NGS（PBAT-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 1.6 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- XLSX
- 研究
- hum0090
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-11-18
- DDBJ Search
- JGAD000078 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000078 (新しいタブで開きます)
解析手法
PBAT-seq
- 材料と対象者
- 大腸（右半結腸、左半結腸、直腸）粘膜から腺管分離法で純化した吸収上皮細胞12種類（正常：12細胞）
- 健康状態健常
- 対象者数12 (検体数)
- 試料説明
- 大腸（右半結腸、左半結腸、直腸）粘膜から腺管分離法で純化した吸収上皮細胞より抽出したDNA
- 組織Colorectal mucosa absorptive epithelial cell
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- PBAT-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Post-Bisulfite Adaptor-Tagging (PBAT)
- 断片化
- Post-bisulfite adaptor-tagging（PBAT）法による（Bisulfite変換に伴うDNA切断）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 100 bp