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NBDC ヒトデータベース
JGAD000075
公開日
2020-09-28

更新日
2020-09-28

研究
hum0060

データの種類
NGS(Exome)

アクセス制限
制限公開(Type I)

JGA Study
JGAS000075

解析手法

WES

材料と対象者

再発・転移性乳がん: 65症例(175検体)

実験方法

Exome

プラットフォーム

Illumina [HiSeq 2000]

試料説明

非腫瘍組織、原発巣(腫瘍組織)、および、転移巣(腫瘍組織)から抽出したDNA

ライブラリ構築

SureSelect Human All Exon V5 + lincRNA

断片化

超音波断片化(Covaris E220)

リードタイプ

Paired-end

リード長

100 bp

JGAデータセットAccession
総データ量

4 TB(fastq [350 files])

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